Mae yna lawer o ddamcaniaethau am darddiad enw'r afal Fuji, ond dyma ddau brif esboniad:
Seren Ffilm ac Enw Lle:
Enwyd yr afal Fuji yn "Fuji" oherwydd bod ei fridiwr yn edmygu'r seren ffilm enwog ar y pryd, Fujiko Yamamoto, ac oherwydd bod y cyltifar yn tarddu o Fujisaki, tref â chysylltiadau â'r ddau.
Cysylltiad ag Enw Lle ac Ansawdd:
Mae damcaniaeth arall yn awgrymu bod enw afal Fuji yn fwy cysylltiedig â Fujisaki oherwydd bod "Fuji" hefyd yn cyfeirio at Fynydd Fuji yn Japan. Mae'r enw hwn nid yn unig yn tynnu sylw at darddiad Japaneaidd yr amrywiaeth ond hefyd yn awgrymu bod ansawdd y ffrwythau mor eithriadol â Mynydd Fuji.
Cyfuniad o Gyfieithu Seinnig a Llenyddol Saesneg:
Mae damcaniaeth arall yn awgrymu bod enw'r afal Fuji yn dod o gyfuniad o'r cyfieithiad ffonetig a llythrennol o'r enw Saesneg, "Fuji." Mae "Fu" yn cyfeirio at y cnawd toreithiog, tra bod "Shi" yn cyfeirio at drin yr ysbryd samurai yn fanwl. Mae'r strategaeth enwi hon wedi gwella adnabyddiaeth ryngwladol yr amrywiaeth.
